A civilização do reino de Nusgarde prosperou em uma terra árida, sob a bênção de Sephirot da Árvore da vida. Os habitantes de Nusgarde descobriram que Sephirot fazia parte da árvore do mundo, que existia em outro mundo, Eingard.
Eles então começaram a construção de um portal dimensional, Elyon, e uma enorme aeronave para alcançar para Eingard e obter uma grande fonte de energia.
No entanto, pouco antes de Elyon começar a operar, eles foram atacados por um exército de máquinas, conhecidos como Apóstolos Negros. A aeronave Inventus foi seriamente danificada e corre o risco de cair.
Eingard, onde ninguém chegou; e Elyon, a única maneira de alcançá-lo.
A grande guerra para dominar Elyon começou.
